1 Narración
La imagen de la Limpia Concepción regalada por el misionero fray Miguel de Bolonia, fue adquiriendo fama a partir de 1623 con la reanimación de una niña, hija de un cirquero que se dirigía a Guadalajara junto con su mujer y sus dos hijas; se detuvo unos cuatro días en San Juan mientras enseñaba acrobacias a sus hijas; pero una de ellas, resbaló y cayó sobre las puntas de las espadas y se mató.
No se conoce la fecha exacta ni el nombre de la niña del primer milagro, pero según los testigos oculares, cuando llevaron la niña a la pequeña capilla de adobe y techo de paja, y se disponían a enterrarla, una indígena llamada Ana Lucía, esposa de Pedro Andrés, el encargado de la capilla, colocó la imagen de la Virgen sobre el cuerpo muerto de la niña, devolviéndole la vida. Ana Lucía, anciana de unos 70 años, les había dicho que la Cihuapilli ("Señora") la curaría; y sacó la imagen de uno de los dos cuartitos, que servía de sacristía y la colocó sobre el pecho de la niña, y al poco rato la vieron moverse, le cortaron las ligaduras de la mortaja y la niña se levantó buenisana.
Ana Lucía explicó que se le ocurrió acudir a la imagen de la Señora porque cuando de madrugada llegaba a barrer la capilla, la imagen ya estaba sobre la peana del altar, puesta por sí o por los ángeles, y ella la tomaba y la volvía a la sacristía, donde la habían puesto porque estaba afeada por el tiempo y apolillada y la habían reemplazado en el altar con otra imagen de nuestra Señora.
El volantinero pidió que le permitieran mandarla retocar en agradecimiento; cuando llegó a Guadalajara, llegaron unos jóvenes a donde se hospedó, y preguntaron si había alguna pintura o escultura qué arreglar, pues a eso se dedicaban; él les entregó la imagen esa misma noche; al día siguiente, muy de madrugada la entregaron ya arreglada y desaparecieron antes de que el volantinero pudiera verlos o los del lugar darles el recado de esperar a aquél. Cuando la trajo a San Juan, contó lo sucedido; y los indios la pusieron en el altar donde amanecía todos los días.
Este acontecimiento cambió para siempre la vida de San Juan. La muerte de la niña y el dolor de sus padres -españoles- había conmovido a los indios, y en cierto modo había unido dos razas; y si el dolor los había reconciliado, el milagro los hermanó; diez años después, el 3 de julio de 1633, la Real Audiencia autorizó a familias españolas poblar el lugar que fue llamado "Villa" de San Juan de los Lagos (el Congreso del Estado la elevaría al rango de ciudad hasta el 30 de octubre de 1869).
El año 1634 el obispo de Guadalajara, Leonel Cervantes de Carvajal, ordenó una investigación juramentada de los hechos. Los testigos oculares declararon ante el capellán Pbro. Juan Contreras Fuerte, que recogió también el informe del párroco de Jalostotitlán, Diego Camarena, que conoció personalmente a la india Ana Lucía. El Pbro. Juan Contreras encontró una ermita de veinte por ocho varas, cubierta de paja, con dos piecesitas; la imagen estaba en una como cajita, que servía de tabernáculo; en sus puertitas estaban pintados San Joaquín y Santa Ana.

2 La Devoción
La devoción a la imagen se ha extendido particularmente por el centro del país, pero vienen personas del norte y hasta del extranjero. Sin duda las más concurridas son las de la Candelario, pero son igualmente multitudinarias las del 15 de agosto y las del 8 de diciembre. En los últimos años toman cada vez más fuerza semana santa, navidad y fin de año.
La gente suele traer objetos para dejar como testimonio de los "favores" recibidos por intercesión de María. En los puestos aledaños compran objetos religiosos, como imágenes o veladoras, que luego llevan a bendecir. Una buena cantidad de ellos entra de rodillas, procura confesarse y comulgar. Desde luego, aprovecha para pedir nuevas gracias y hace el propósito de volver a San Juan.