Il y a de nombreuses différences morphologiques entre putois et furets, dont des changements dans le squelette et l’arcade dentaire, la taille et la forme du corps, la coloration de la fourrure, sa longueur et sa qualité et la taille du cerveau.
Ces différences sont fortement variables, d’insignifiantes chez un furet à profondes chez un autre.
La plus significative des différences crâniennes est la largeur de la constriction postorbitale.
Chez les furets, les putois des steppes et les furets à pieds noirs, la constriction postorbitale est assez étroite, alors que chez les putois d’Europe, elle est significativement plus large.
La capacité crânienne du furet est environ 15—20% plus plus petite que chez les putois, reflétant la diminution typique de la taille du cerveau pendant la domestication [Ashton 1955; Darlington 1957; Kruska 1996; Lawes and Andrews 1987; Roehrs 1986].
Les dents sont généralement plus serrées à cause d’un raccourcissement du maxillaire et de la mandibule du furet (juvénilisation faciale), affectant l’arcade dentaire.
Les pathologies dentaires incluent des dents en trop (excédentaires), se chevauchant, malformées et une mauvaise occlusion [Bateman 1970; Berkovitz 1969; Berkovitz and Silverstone 1969; Glas 1977; Hayssen et al. 1993; Ruprecht 1978].
L’albinisme et la dépigmentation sont des changements morphologiques profonds et un indicateur certain de la domestication; l’albinisme est rarement rencontré dans la nature, et le maintien de cet état s’est fait jusque là par la sélection de l’homme. Chez les furets, l’albinisme est associé à des changements visuels et structurels dans le système nerveux [Grandin and Deesing 1998; McLain et al. 1985; Pontenagel and Schmidt 1980; Tjalve and Frank 1984].
Ces dernières années, la sélection pour obtenir des races de compagnie a abouti à une large série de variations dans la couleur de la robe et dans les textures et les longueurs des fourrures, chacune résultant de l’interaction entre deux loci de gènes ou plus [Grafodatskii et al. 1978; McLain et al. 1985; Miclea et al. 1994; Syed et al. 1987].
Les furets domestiques ont légèrement diminué la taille de leur corps en comparaison avec les putois et le degré de dimorphisme sexuel semble légèrement inférieur. Cependant, de tels changements peuvent être induits par l’environnement—plutôt que génétiques—et causés par le maternage, la stérilisation ou le régime alimentaire, aussi ne seront-ils pas abordés.